Jan Patočka se narodil v roce 1907 v Turnově jako jeden ze čtyř synů gymnaziálního profesora Josefa Patočky, v té době už okresního školního inspektora, a matky Františky, v mládí sopránové zpěvačky v plzeňské opeře a na venkovských stagionách. Do roku 1913 působil otec jako ředitel vzdělávacího učitelského ústavu v Poličce. Do první třídy nastupuje malý Jan již v Praze, kde byl otec jmenován přednostou zemského učitelského ústavu. Z bytu v Perunově ulici č. 4 na Královských Vinohradech, tehdy ještě samostatné obci, přebíhá Jenda (jak bude rodiči oslovován ještě jako dospělý) do sousední školy hned vedle domu. Později pak kolem vinohradské vodárenské věže a přes park do reálného gymnázia ve Slovenské ulici. Tam také skládá dne 22. června 1925 zkoušku dospělosti.