Druhý a třetí díl dvanáctisvazkového životního díla významného historika a politika obsahuje větší část třetí knihy pražských dějin věnované období od založení Nového Města pražského do skončení husitských válek za krále Zikmunda (1348-1436). Vzhledem k rozsahu nashromážděného materiálu rozdělil autor látku třetí knihy původně do dvou a nakonec do tří svazků. První svazek (II. díl celého souborného díla) obsahuje 1. oddíl třetí knihy (pražské události za panování Karla IV.) a první dvě části 2. oddílu (popis Prahy za Karla IV. a Václava IV. - místopis a pražské měšťanstvo). Druhý svazek (III. díl souboru) zahrnuje dokončení 2. oddílu (královský dvůr a zemská správa, duchovenstvo) a první část 3. oddílu třetí knihy (pražské dějiny od smrti Karla IV. do smrti Václava IV. (1378-1419). Dokončení třetí knihy (4. oddíl - Praha ve válce náboženské za krále Zikmunda 1419-1436) je součástí IV. dílu souboru. - Jmenný a místní rejstřík.
Desátý, jedenáctý a závěrečný dvanáctý díl nedokončeného životního díla českého historika a politika popisují pražské události let 1478-1608 (od uzavření Olomouckého míru do stavovské bouře r. 1547 a od její porážky do Matyášova povstání r. 1608). X. díl souboru zahrnuje třetí oddíl čtvrté knihy pražských dějin a věnuje se historickým událostem od uzavření Olomouckého míru mezi Vladislavem II. Jagellonským a Matyášem Korvínem do smrti krále Ludvíka Jagellonského (1478-1526). XI. dílem souboru se uzavírá čtvrtá kniha - její čtvrtý oddíl mapuje události od bitvy u Moháče do stavovské bouře r. 1547. Součástí je též popis úředníků a důstojníků světských i duchovních a jmenný a místní rejstřík. XII. díl souboru zahajuje prvním oddílem věnovaným událostem od porážky stavovské bouře r. 1547 do Libeňského míru mezi císařem Rudolfem a jeho bratrem Matyášem (1547-1608) pátou knihu, jež měla být dovedena až do Westfálského míru r. 1648.