Surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) traditionally requires special substrates, typically in the form of noble metal nanostructures, and facilitates detection of molecules at extremely low concentrations. In this work, we present fabrication of novel type of SERS active substrates that combine promising properties of metal nanostructures and graphene, and demonstrate their application in biosensing. The graphene-metal hybrids are fabricated by guided assembly of colloidal gold nanoparticles on e-beam pre-patterned silicon substrate. Gold nanoparticles are then subsequently covered with graphene. The usefulness of such structures in SERS biosensing is tested upon detection of Rhodamine 6G molecules. and Povrchem zesílená Ramanova spektroskopie (SERS) tradičně využívá speciálně upravených povrchů, nejčastěji ve formě kovových nanostruktur, a umožňuje detekci látek o velmi nízkých koncentracích. Tato práce pojednává o přípravě nového typu substrátu vhodného pro metodu SERS kombinujícího výhodné vlastnosti jak kovových struktur, tak i grafenu. Grafen-kovové hybridní nanostruktury byly vyrobeny řízenou depozicí zlatých kuliček na elektronovým svazkem ozářený křemíkový substrát a následným překrytím vrstvou grafenu. Možnost využití výsledných struktur v oblasti biosenzorů byla dále testována při detekci molekul rhodaminu nanesených na jejich povrch.