Počítačové modelování biomolekul je zaměřeno na studium struktury, dynamiky a vzájemných interakcí nukleových kyselin, proteinů a buněčných membrán, zkoumání katalytického účinku enzymů, racionální návrh struktury nových léků atd. K dispozici je celá škála metod - bioinformatika, klasické molekulárně-dynamické (MD) simulace, kvantově-chemické ab initio výpočty, popř. kombinované QM/MM přístupy. Mezi softwarovými balíky většinou existuje i víceméně plnohodnotná freewarová alternativa., Computer modeling of biomolecules is aimed at studying the structure, dynamics and interaction of nucleic acids, proteins and cell membranes, examining the catalytic effect of enzymes, rational drug design etc. There is a whole range of methods - bioinformatics, classical molecular dynamic (MD) simulations, quantum-chemical ab initio calculations, or combined QM/MM approaches. Among the software packages there is usually more of less full-featured freeware alternatives., Ivan Barvík., and Obsahuje bibliografii
Tento příspěvek představuje výsledky mé disertační práce na téma remodelace tkání s důrazem na tkáň kostní. Pro studium a modelování tohoto procesu jsme vyvinuli biotermodynamický koncept remodelace, který umožňuje zahrnutí obou zásadních vlivů: mechanické stimulace i biochemických podmínek. Na typických onemocněních spojených s remodelací dokumentujeme použitelnost modelu., This article presents key results from the author's Ph.D. thesis on tissue remodelling with focus on bone tissue. We have developed a biothermodynamic concept of remodeling, for studying and modelling, of this process which enables to inclusion of two crucial factors: mechanical stimulation and biochemical conditions. We use typical diseases related to remodelling to show the apllicability of the model., Václav Klika., and Obsahuje bibliografii