Search

Start Over Subject ryby Date Unknown

2. A new R package and web application for detecting bilateral asymmetry in parasitic infections

Creator:
Wayland, Matthew T and Chubb, James C
Format:
print, počítač, and online zdroj
Type:
model:article and TEXT
Subject:
motolice, ryby, software, statistická analýza, Trematoda, fishes, statistical analysis, bilateral asymmetry, Diplostomum, Gymnocephalus cernua, ruffe, 2, and 59
Language:
English
Description:
When parasites invade paired structures of their host non-randomly, the resulting asymmetry may have both pathological and ecological significance. To facilitate the detection and visualisation of asymmetric infections we have developed a free software tool, Analysis of Symmetry of Parasitic Infections (ASPI). This tool has been implemented as an R package (https://cran.r-project.org/package=aspi) and a web application (https://wayland.shinyapps.io/aspi). ASPI can detect both consistent bias towards one side, and inconsistent bias in which the left side is favoured in some hosts and the right in others. Application of ASPI is demonstrated using previously unpublished data on the distribution of metacercariae of species of Diplostomum von Nordmann, 1832 in the eyes of ruffe Gymnocephalus cernua (Linnaeus). Invasion of the lenses appeared to be random, with the proportion of metacercariae in the left and right lenses showing the pattern expected by chance. However, analysis of counts of metacercariae from the humors, choroid and retina revealed asymmetry between eyes in 38% of host fish., Matthew T. Wayland, James C. Chubb., and Obsahuje bibliografii
Rights:
http://creativecommons.org/publicdomain/mark/1.0/ and policy:public

3. A synoptic review of Promonobothrium Mackiewicz, 1968 (Cestoda: Caryophyllidea), parasites of suckers (Catostomidae) in North America, with description of two new species

Creator:
Oros, Mikuláš, Jan Brabec, Roman Kuchta, Choudhury, Anindo, and Tomáš Scholz
Format:
print, počítač, and online zdroj
Type:
model:article and TEXT
Subject:
ryby, systematická zoologie, fylogeneze, fishes, animal classification, phylogeny, eucestoda, comparative morphology, taxonomy, new species, Nearctic Region, identification key, molecular phylogeny, 2, and 59
Language:
English
Description:
Monozoic cestodes of the recently amended genus Promonobothrium Mackiewicz, 1968 (Cestoda: Caryophyllidea), parasites of suckers (Cypriniformes: Catostomidae) in North America, are reviewed, with information on their host specificity, distribution and data on the scolex morphology of seven species studied for the first time using scanning electron microscopy (SEM). Evaluation of type and voucher specimens from museum collections and newly collected material of most species indicated the following valid nominal species: Promonobothrium minytremi Mackiewicz, 1968 (type species); P. ingens (Hunter, 1927); P. hunteri (Mackiewicz, 1963); P. ulmeri (Calentine et Mackiewicz, 1966); P. fossae (Williams, 1974) and P. mackiewiczi (Williams, 1974). Rogersus Williams, 1980 with its only species R. rogersi is transferred to Promonobothrium based on morphological and molecular data. Promonobothrium currani sp. n. and P. papiliovarium sp. n. are described from Ictiobus bubalus (Rafinesque) and Ictiobus niger (Rafinesque), and Erimyzon oblongus (Mitchill), respectively. The newly described species can be distinguished from the other congeners by the morphology of the scolex, the position of the anteriormost vitelline follicles and testes, the presence of postovarian vitelline follicles and the shape of the ovary. Molecular phylogenetic analyses of six species based on sequences of the small and large subunits of the nuclear ribosomal RNA genes (ssrDNA, lsrDNA) confirmed the monophyletic status of the genus and supported the validity of the species analysed. A key to identification of all species of Promonobothrium based on morphological characteristics is provided., Mikuláš Oros, Jan Brabec, Roman Kuchta, Anindo Choudhury, Tomáš Scholz., and Obsahuje bibliografii
Rights:
http://creativecommons.org/publicdomain/mark/1.0/ and policy:public

4. An analysis of osteological material from the late Funnel Beaker culture settlement in Brozany, northwestern Bohemia

Creator:
Kyselý, René
Type:
article, model:article, and TEXT
Subject:
archaeozoology, Eneolithic, puppies, human newborns, fox, bird, fish, Apodemus, Unio, bone artefacts, archeozoologie, eneolit, štěňata, lidští novorozenci, liška, ptáci, ryby, velevrub, and kostěné artefakty
Language:
Czech
Description:
An analysis of the bones from the settlement in Brozany nad Ohří (Litoměřice district) dated to the Salzmünde phase of the Funnel Beaker culture revealed standard characteristics for the reconstruction of the paleoeconomic situation and provided information regarding several unusual and interesting finds. There is a distinct predominance of domestic animals over wild species, with cattle being the most prominent domestic species. A total of sixteen species of wild animals were identified. Interesting finds include pig skulls, a complete skeleton of a fox, bones from perhaps synanthropic field mice, a fragment of an eagle bone, a vertebra from a large salmonid fish, scales from asp and chub and an assemblage of eight probably intentionally perforated shells. The skeletal remains of eight puppies were found in two settlement features, and skeletal remains of three newborn humans were also found in two settlement features. The co-occurrence of puppies and newborns in the same context indicates their equal depositional status. The material also contains a number of bone artefacts. and Rozbor kostí pocházejících ze sídliště v Brozanech nad Ohří (okr. Litoměřice), datovaného do salzmündské fáze kultury nálevkovitých pohárů, přinesl jak standardní charakteristiku paleoekonomické situace, tak i informace o několika neobvyklých a zajímavých nálezech. V materiálu výrazně převládají domácí zvířata nad divokými a mezi domácími zvířaty dominuje tur. Divokých živočichů bylo detekováno celkem 16 druhů. Zajímavými nálezy jsou kompletní lebky prasat, skelet lišky, kosti snad synantropních myšic, fragment kosti orla, obratel velké lososovité ryby a kumulace šupin bolena a jelce a soubor osmi perforovaných lastur velevrubů. Ve dvou sídlištních objektech byly nalezeny pozůstatky celkem osmi štěňat a ve dvou sídlištních objektech byla nalezena torza kostřiček tří lidských novorozenců. Unikátní je spolu-výskyt štěňat a novorozenců v témže kontextu naznačující jejich rovnocennost při deponování. Materiál obsahuje i soubor kostěných artefaktů.
Rights:
http://creativecommons.org/publicdomain/mark/1.0/ and policy:public

5. Anuální halančíci - ryby adaptované na sezonně vysychající biotopy

Creator:
Martin Reichard
Type:
article, články, journal articles, model:article, and TEXT
Subject:
Zoologie, zoologie, plazi, ryby, obojživelníci, životní prostředí, ekologie, reptiles, fishes, amphibians, environment, ecology, 2, and 59
Language:
Czech
Description:
Halančíci rodu Nothobranchius jsou přizpůsobeni životu v periodických vodních tůních v afrických savanách. Období sucha přežívají v embryonální fázi vývoje. V současné době se rozeznává přes 60 druhů halančíků rodu Nothobranchius, kteří žijí v travnatých savanách a řídkém sezonním lese v širokém pásu východní Afriky. Druh N. furzeri se stal modelovým organismem pro výzkum stárnutí a věnují se mu v několika laboratořích v Evropě, USA a Asii. Náš výzkum se zaměřuje hlavně na evoluční ekologii tří druhových komplexů tohoto rodu v oblasti jižního a středního Mosambiku., Killifish from the genus Nothobranchius are adapted to temporal pools in African savannahs. They survive the dry phase as dormant eggs and develop rapidly after the onset of rainy season. There are about 60 species of Nothobranchius distributed throughout Eastern Africa. One species group became a model for studies on ageing. Our current field and laboratory research on annual Killifish from Mozambique is reviewed and particular studies on their ecology and evolution are highlighted., and Martin Reichard.
Rights:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ and policy:public

7. Chování a role ryb v evropských nádržích a jezerech

Creator:
Říha, Milan
Type:
article, články, journal articles, model:article, and TEXT
Subject:
Zoologie, zoologie, ryby, obojživelníci, plazi, životní prostředí, ekologie, fishes, amphibians, reptiles, environment, ecology, 2, and 59
Language:
Czech
Description:
Článek shrnuje současné znalosti o distribuci ryb a její dynamice v našich přehradních nádržích. Především jsou popsány změny distribuce ryb v průběhu a mezi několika důležitými obdobími, jako je třecí období, období sběru potravy a zimní období. Dále je diskutován přínos současného rozvoje metodik vzorkování ryb k porozumění jejich distribučních vzorců., This paper summarizes current knowledge of fish distribution and its dynamics in Czech water reservoirs. The dynamics of fish distribution is described during the three periods, including spawning, feeding and wintering. And the importance of current fish sampling technique innova­tions for understanding fish distribution patterns is also discussed., and Martin Říha a kolektiv autorů.
Rights:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ and policy:public

8. Cizorodé látky ve vodním prostředí a jejich vliv na ryby

Creator:
Tomáš Randák
Type:
article, články, journal articles, model:article, and TEXT
Subject:
Zoologie, chemické látky, vodní ekosystémy, ryby, chemicals, water ecosystems, fishes, 2, and 59
Language:
Czech
Description:
Pollution of the water environment by foreign substances is an important factor affecting the health of fish, their reproduction and hygienic quality. Almost 100,000 chemical compounds are currently used, and get into the environment. This article describes the causes and sources of water pollution and deals with the known effects of particular contaminants, including mercury, on freshwater fish, i. a. in terms of their position in the food chain. and Tomáš Randák.
Rights:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ and policy:public

9. Co je nového v evoluční biologii. Genom latimérií

Creator:
Petr Ráb
Format:
print
Type:
article, články, journal articles, model:article, and TEXT
Subject:
Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce, evoluční biologie, genetika, ryby, evolutionary biology, genetics, fishes, 2, and 575
Language:
Czech
Description:
V r. 2013 dvě nezávislé skupiny osekvenovaly kompletní genomy obou taxonomicky známých druhů latimérií (Latimeria). Článek krátce shrnuje celou historii jejich objevu, zeměpisné rozšíření a stručně podává přehled vývoji poznatků o jednotlivých částech jejich genomu. Poté komentuje výsledky zmíněných celogenomových studií zejména vzhledem ke dvěma skupinám genů - společné pro paprskoploutvé ryby (Actinopterygii) a latimérii a společné pro latimérii a čtvernožce (Tetrapoda)., Two independent research groups decipher the complete genomes of both taxonomically known species of the genus Latimeria. This note briefly summarizes the discovery and geographic distribution of coelacanth species, and overviews the history of findings dealing with various parts of their genomes. It also comments on the results of both whole genome sequencing studies, especially as regards two gene groups - those present in ray-finned fishes (Actinopterygii) and coelacanth and those present in coelacanth and tetrapods., and Petr Ráb.
Rights:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ and policy:public

10. Diverzita evropských sladkovodních ryb aneb opožděná recenze

Creator:
Petr Ráb
Type:
article, články, journal articles, model:article, and TEXT
Subject:
Zoologie, zoologie, ryby, obojživelníci, plazi, recenze, fishes, amphibians, reptiles, reviews, 2, and 59
Language:
Czech
Description:
Kniha M. Kottelata a J. Freyhofa Handbook of European Freshwater Fishes (Cornol a Berlin 2007) je recenzována s rozsáhlým komentářem a je poukázano na její vpravdě „revoluční“ pojetí. Kniha jasně ukazuje na předtím netušenou velkou diverzitu evropských sladkovodních ryb a dokumentuje existenci téměř 550 původních a 33 nepůvodních druhů ryb, kde každý druh v knize doprovází popis, diagnostické znaky a většinou dokonalé fotografie. Význačným poselstvím knihy je také upozornění na různý stupeň ohrožení u téměř 40 % existujících druhů., The Handbook of European Freshwater Fi­shes by M. Kottelat and J. Freyhof (Cornol and Berlin 2007) is reviewed with extensive comments showing its indeed “revolu­tionary” concept. The book clearly demonstrates the previously unexpected great diversity of European freshwater fishes and documents the occurrence of nearly 550 autochthonous and 33 alien species (each species is described, diagnosed, in most cases accompanied by excellent photos). The significant message of the book is also the fact that almost 40 % of recorded species are under various degrees of threat., Petr Ráb., and Obsahuje seznam literatury
Rights:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ and policy:public