Vítězslav Havlíček ; autorem úvodu společného i pro předchozí a následný článek je redakce. and Přetištěno ze Sborníku pro dějiny přírodních věd a techniky 11, 57-79 (1966)
Počítačové modelování biomolekul je zaměřeno na studium struktury, dynamiky a vzájemných interakcí nukleových kyselin, proteinů a buněčných membrán, zkoumání katalytického účinku enzymů, racionální návrh struktury nových léků atd. K dispozici je celá škála metod - bioinformatika, klasické molekulárně-dynamické (MD) simulace, kvantově-chemické ab initio výpočty, popř. kombinované QM/MM přístupy. Mezi softwarovými balíky většinou existuje i víceméně plnohodnotná freewarová alternativa., Computer modeling of biomolecules is aimed at studying the structure, dynamics and interaction of nucleic acids, proteins and cell membranes, examining the catalytic effect of enzymes, rational drug design etc. There is a whole range of methods - bioinformatics, classical molecular dynamic (MD) simulations, quantum-chemical ab initio calculations, or combined QM/MM approaches. Among the software packages there is usually more of less full-featured freeware alternatives., Ivan Barvík., and Obsahuje bibliografii
Tento příspěvek představuje výsledky mé disertační práce na téma remodelace tkání s důrazem na tkáň kostní. Pro studium a modelování tohoto procesu jsme vyvinuli biotermodynamický koncept remodelace, který umožňuje zahrnutí obou zásadních vlivů: mechanické stimulace i biochemických podmínek. Na typických onemocněních spojených s remodelací dokumentujeme použitelnost modelu., This article presents key results from the author's Ph.D. thesis on tissue remodelling with focus on bone tissue. We have developed a biothermodynamic concept of remodeling, for studying and modelling, of this process which enables to inclusion of two crucial factors: mechanical stimulation and biochemical conditions. We use typical diseases related to remodelling to show the apllicability of the model., Václav Klika., and Obsahuje bibliografii
Článok jednoduchým spôsobom, bez potreby hlbšej znalosti kvantové mechaniky, popisuje metódy superpočítačového modelovania na nanoškále. V prvej časti sa popisujú základy metód simulácie elektrón-iónového systému s dôrazom na metódy teórie hustotového funkcionálu, které umožňujú študovat dĺžkové a časové škály relevantné pre nanotechnológie. Stručne sú popísané aj mnohočasticové metódy, najmä metóda kvantového Monte Carla,ktorá má výrazne vyššiu presnosť pri podobnom asymptotickom škálování a má preto potenciál stať sa štandardom vysokej presnosti modelovania na nanoškále. Možnosti týchto metód demonštrujeme na príkladoch, ktoré pokrývajú širokú škálu materiálov a metód relevantných pre nanotechnológie., Ivan Štich, Marek Mihalkovič, Marian Krajčí., and Obsahuje seznam literatury