Polyploidie je důležitým evolučním mechanismem přispívajícím k biodiverzitě současných ryb a také významným nástrojem v akvakultuře. Tento článek podává přehled o mechanismech vzniku polyploidie a o kauzálním vztahu mezi hybridizačními událostmi a zvýšením stupně ploidie. Uvádí rovněž příklady využití specifických vlastností polyploidů v akvakultuře., Polyploidy is an important evolutionary mechanism contributing to the biodiversity of extant fishes, and it also represents a notable tool in aquaculture. This paper reviews the mechanisms by means of which polyploidy arises and the causal relationship between hybridisation events and elevation of the ploidy level. Utilization of specific traits of polyploids in aquaculture is also discussed., Martin Flajšhans, Petr Ráb., and Obsahuje seznam literatury
Functional C(-260)→T polymorphism in the promoter of the CD14 gene has been reported to be associated with coronary heart disease (CHD). The functional role of the polymorphism, however, is still a matter of debate, since several studies have not proved its effect on clinical outcomes associated with atherosclerosis. Cardiovascular-related morbidity and mortality was assessed in a post-hoc approach four years after baseline characterization of patients (male/female n = 36/32) with angiographically proven coronary heart disease. CD14 C(-260)→T promoter genotype was determined at baseline. Seventeen out of 20 CHD patients with non-lethal cardiovascular events carried at least one T-allele. CD14 T-260 allele carriers have a 3.59-fold (95 % confidence interval: 1.11-6.75) increased risk for non-lethal cardiovascular events (Kaplan-Meier plot: log rank test p = 0. 029). All patients with lethal outcomes (n = 6) were also T-allele carriers. Multivariate logistic regression analysis among CHD patients including age, established risk factors and the C(-260)→T polymorphism as covariates and non-lethal events as a dependent variable confirmed the independent prospective effect of the T-allele on cardiovascular outcomes in this subset. Further evidence is provided for the role of CD14 C(-260)→T promoter polymorphism as a genetic susceptibility marker of atherosclerosis in patients with an advanced clinical course of the disease. Due to the small sample size and post-hoc character of the study large-scale prospective studies that monitor patients with proven CHD are needed to confirm these findings., M. Porsch-Öucürümez, J.Hucke, S. Westphal, J. A. Hubáček, G. Schmitz, C. Luley., and Obsahuje bibliografii a bibliografické odkazy
Prague hereditary hypercholesterolemic (PHHC) rat – rat strain crossbred from Wistar rats – is a model of hypercholesterolemia induced by dietary cholesterol. Importantly, no bile salts and/or antithyroid drugs need to be added to the diet together with cholesterol to induce hypercholesterolemia. PHHC rats have only modestly increased cholesterolemia when fed a standard chow and develop hypercholesterolem ia exceeding 5 mmol/l on 2 % cholesterol diet. Most of the cholesterol in hypercholesterolemic PHHC rats is found in VLDL that become enriched with cholesterol (VLDL-C/VLDL-TG ratio > 1.0). Concurrently, both IDL and LDL concentrations rise without any increase in HDL. PHHC rats do not markedly differ from Wistar rats in the activities of enzymes involved in intravascular remodelation of lipoproteins (lipoprotein and hepatic lipases and lecithin:cholesterol acyltransferase), LDL catabolism, cholesterol turnover rate and absorption of dietary cholesterol. The feeding rats with cholesterol diet results in development of fatty liver in spite of suppression of cholesterol synthesis. However, even though cholesterolemia in PHHC rats is comparable to human hypercholesterolemia, the PHHC rats do not develop atherosclerosis even after 6 months on 2 % cholesterol diet. Importantly, the crossbreeding experiments documented that hypercholesterolemia of PHHC rats is polygenic. To identify the genes that may be involved in pathogenesis of hypercholesterolemia in this strain, the studies of microarray gene expression in the liver of PHHC rats are currently in progress., J. Kovář ... [et al.]., and Obsahuje seznam literatury
Jedním ze zdrojů informací o pravěku je mitochondriální DNA (mtDNA). Díky mutacím, které v její molekule v průběhu času zcela přirozeně vznikají, lze rekonstruovat fylogenetický strom a datovat vznik jednotlivých větví i jejich další vývoj v jednotlivých oblastech světa. První evropské větve lidské mtDNA fylogeneze jsou zřejmě starší více než 50 tis. let a pocházejí s největší pravděpodobností z Předního východu. Díky mtDNA bylo rovněž zjištěno, jak se na složení evropského genofondu projevilo poslední maximum doby ledové před 20 tis. lety, kdy se kvůli ochlazení lidé stáhli do jihoevropských refugií a po oteplení před 15 tis. lety severnější oblasti znovu kolonizovali. Také se předpokládalo, že se vznikem zemědělství před 10 tis. lety proběhla další větší migrace z Předního východu. Ve střední Evropě je ale námi zjištěný příspěvek ,,neolitických“ mtDNA linií poměrně malý, takže se zemědělství v této oblasti šířilo spíše akulturací původních obyvatel, tedy přenosem kulturních dovedností. Výsledky odpovídají i demografickým modelům populačního růstu., According to the human mitochondrial DNA (mtDNA) phylogeny, European first branches seem to be more than 50 000 years old and may have originated in the Near East. MtDNA has also revealed how the composition of the European gene pool changed in association with the Last Glacial Maximum 20 000 years ago when the European population retreated into southern refugia and how after the amelioration of the climate some 15 000 years ago it re-colonized northern regions. The contribution of “Neolithic” mtDNA lineages in Central Europe has been determined as relatively small and agriculture probably spread more by the acculturation of indigenous inhabitants., and Edita Priehodová.
It is said that dog genome has 2 385 199138 base couples and 20 439 genes which is less than man. It has been described as having about 2,5 million polymorphisms which give us knowledge about more than 400 various kinds of dogs. and Jaromír Dostál.
Over the last decade, C-reactive protein concentration analyzed by the high sensitivity method (hsCRP) has been proven as a marker of premature atherosclerosis. Concentration exceeding 2 mg/l represents an increased individual risk of myocardial infarction and stroke but strict application of this borderline is complicated by relations of CRP concentrations to other risk factors of cardiovascular diseases. In a large 1 % representative sample of the Czech population, a positive relation of hsCRP to BMI, a waist circumference and triglyceride concentration was documented. Substantial sex differences were found in its relationship to age. Whereas it is continuously increasing in men, this increase appears in women only after menopause. A substantial decrease of body weight and visceral fat volume by increased physical activity is accompanied by significant decrease of hsCRP in young obese women. This decrease was not related to a change of interleukin-6 concentration, although it is supposed to regulate CRP production. CRP concentration is partly under genetic control as a higher concentration in young siblings of probands with proved coronary atherosclerosis was documented. The participation of genes related to lipoprotein metabolism (genes for apolipoprotein CI and apolipoprotein E) influence hsCRP concentrations. We hypothesized that an increased concentration of hsCRP represents a certain marker of proinflammatory status related to central obesity and triglyceride metabolism and it might be related to individual properties of monocytes in atherogenesis., R. Poledne ... [et al.]., and Obsahuje seznam literatury
Přijetím konceptu deskové tektoniky v 60. letech 20. století se od základu změnil náhled na původ latinskoamerické flóry. Zjistilo se, že dnešní kontinent Jižní Ameriky byl před 100 miliony lety součástí pradávného kontinentu Gondwany a její jednotné flóry. Tento poznatek vedl k interpretaci vzniku disjunktních areálů taxonů rozšířených v Jižní Americe a na ostatních částech bývalé Gondwany v důsledku rozpadu dřívějšího kontinuálního areálu výskytu. Po následném oddělení kontinentu Jižní Ameriky od Gondwany přibližně před 100 miliony lety se předpokládalo, že se zde vegetace vyvíjela izolovaně až do vytvoření Panamské šíje před 3 miliony lety. Novější výzkumy a použití tzv. molekulárních hodin však ukazují, že výměna bioty mezi Jižní Amerikou a sousedícími kontinenty v určitých obdobích ještě před uzavřením Panamské šíje přeci jen probíhala., The concept of plate tectonics accepted during the 20th century fundamentally altered general opinion on the origin of Latin American flora. South America formed a part of the ancient continent Gondwana, which had a unique flora. The separation of South America finished about 100 million years ago led to the isolation of its flora until the formation of the Isthmus of Panama about three million years ago. The current disjunctions of widely distributed tropical taxa originated after this disruption. However, recent studies based on molecular clock approaches show that the migration of biota between South America and the rest of the world occurred repeatedly even before the closure of the Isthmus., and Anna Potůčková, Daniel Stančík.
The spontaneously hypertensive rat (SHR) is the most widely used animal model of essential hypertension an d accompanying metabolic disturbances. Recent advances in sequencing of genomes of BN- Lx and SHR progenitors of the BXH/HXB recombinant inbred (RI) strains as well as ac cumulation of multiple data sets of intermediary phenotypes in the RI strains, including mRNA and microRNA abundance, quantitative metabolomics, proteomics, methylomics or histone modifications, will make it possible to systematically search for genetic variants involved in regulation of gene ex pression and in the etiology of complex pathophysiological traits. New advances in manipulation of the rat genome, including e fficient transgenesis and gene targeting, will enable in vivo functional analys es of selected candidate genes to identify QTL at the molecular level or to provide insight into mechanisms whereby targeted genes affect pathophysiological traits in the SHR., M. Pravenec ... [et al.]., and Obsahuje bibliografii a bibliografické odkazy
Naše znalosti o ekologii a rozšíření řady druhů hub byly po dlouhou dobu založeny pouze na pozorování plodnic a sporulujících útvarů v terénu a na identifikaci izolovaných druhů hub. Nedávné pokroky a dostupnost metod založených na studiu DNA a jejich téměř rutinní používání v laboratořích rozšířilo naše znalosti o substrátech kolonizovaných různými druhy hub. Na druhou stranu se ukázalo, že některé druhy kolonizují stejný substrát, ale na geograficky velmi vzdálených lokalitách. Některé druhy ani nelze zařadit do jasně vymezené ekologické skupiny, mění svou ekologii v průběhu svého životního cyklu., Our information about the ecology and distribution of particular fungal species has for a long time been based only on observations of fruit bodies and sporulating structures in the field and on identification of isolated fungal strains. Recent developments in molecular methods and their routine use in mycology have revealed that some fungi may colonize different substrates than originally supposed. On the other hand, other fungi colonize their typical habitats in localities that are enormously distant from each other. Some fungi may not be easily assigned to a single ecological group, as they change various life styles during their life cycle., and Ondřej Koukol.